Mikroorganizmaları sınıflandırma
Sistematik-Filogenetik sınıflama
- Mikroorganizmaları filogenetik sınıflaması zor
- Yüksek canlılarda fosillerden yararlanılarak filogenetik sınıflama yapılır
Sayısal(numerical) sınıflama
- Bilgisayar ortamında yapılır
- Özellikle bakteriler için uygulanır
- Görünüm, hücre yapısı, boyanma özellikleri,hareket, spor, üreme özelliği,koloni görünümü, metabolizma, enzimler vb incelenir
- Ortak özellikler gösteren tür tipi
- Türler arası ilişkilerden cins ve daha ileri aile
- Daha ileri sınıflamalar için uygun değil
- Genetik yöntemlerle
- Kromozomda bulunan guanin+cytosin/ tüm DNA
- Bakterileri sınıflandırmada önemlidir
- Her tür için değişmezdir
- G+C/DNA oranı aynı olmasına karşın baz diziliminde değişiklik olasılığı dezavantajı
- DNA-DNA hibridizasyon
- Bakterilerde %70 va daha fazla hibridizasyon aynı tür
- DNA/tRNA , DNA/rRNA hibridizasyon
- Bakteriden bakteriye gen aktarımı
Serolojik yöntemler
- Bakterilerin antijenik özelliklerinden yararlanılır
Kimyasal yapı
- Hücre duvar yapısı
- Proteinler, aminoasitler
- Enzim yapısı
- DNA, RNA nükleotid sıralanışı
- Yağ asitleri profili
Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology
- >2,600 species
- Sadece % 10 insan patojenleri
Sınıflandırılması
- Alemi (regnum)
- Phylum (şube)
- Subphylum (alt şube)
- Divisio (bölüm)
- Clasis (sınıf)
- Subclasis (alt sınıf)
- Ordo (takım)
- Familia (aile)
- Sub familia (alt aile)
- Genus (cins)
- Species (tür)
